Systemy ochrony przed szkodnikami polega na systematycznym sprawdzaniu wszystkich miejsc, w których mogły zagnieździć się szkodniki: głównie gryzonie oraz robaki. Jeżeli już jest bardzo dobrze zorganizowany, umożliwia szybko wykryć co i w jakiej ilości pojawiło się na terenie firmy, czy w magazynie. Bardzo dobry system ochrony przed szkodnikami zawiera również odpowiednie procedury zwalczania szkodników, które są przygotowane jeszcze przed tym, nim się pojawią i dostosowane do zakładu, którego dotyczą.
Monitoring szkodników warto zlecić profesjonalnej firmie, która wie jak eliminować zagrożenie z ich strony. O ile firma zajmuje się nim we własnym zakresie, bywa różnie z jego realizacją. W wielu firmach problem polega na tym, że zbudowane są wszystkie procedury: jak monitorować miejsca strategiczne, jak je zabezpieczać i sprawdzać, czy insekty lub gryzonie się pojawiły. Te procedury obowiązują jednakże wyłącznie na papierze, bo w praktyce nikt (albo większość) ich nie przestrzega. Jeżeli zajmuje się tym zewnętrzny podmiot, który w przypadku niewywiązania się z umowy nie otrzyma wynagrodzenia, zaangażuje się we własneje zadanie do końca. Profesjonalne firmy nie tylko sumiennie podejdą do samego monitoringu, ale będą także działać sprawniej jeżeli chodzi o samo zwalczanie szkodników. Kiedy na terenie magazynu pojawią się owady, niezbędna jest dezynsekcja. Tę można przeprowadzić na kilka sposób. Wybór odpowiedniego uzależniony jest od tego, czy magazyn jest pusty, czy pełny i co w nim się znajduje. Dezynsekcję można wykonaćprzy użyciu takich środków, jak para (czyli gorące powietrze) promieniowanie ultrafioletowe, gaz, lasery). Szkodniki można również usuwać mechanicznie, czyli nawet je wyłapywać do specjalnych pułapek. Dostępne są jeszcze środki biologiczne (użycie innych owadów wyżej położonych w łańcuchu pokarmowym) lub chemiczne (tylko w pustych magazynach, które można późniejszy czas swobodnie przewietrzyć). Wszyscy są zgodni co do tego, że nie gorzej zabezpieczyć magazyn, czy silos przed owadami, niż w przyszłości z nimi walczyć.
Warto sprawdzić: systemy ochrony przed szkodnikami.